Após a reinauguração em março de 2002, se tornou uma boa opção para os estudantes adquirirem novos conhecimentos sobre geologia, mineralogia, pedras preciosas, mineração, história e outros assuntos. Vinculado à Secretaria da Indústria, Comércio e Mineração do Estado da Bahia, o museu já está se transformando em um novo centro cultural e de lazer.
Entre as raridades de seu acervo, destaca-se o sodalita-sienito Azul Bahia, típico da Bahia, cotado internacionalmente em cerca de US$ 500 cada/metro quadrado, e uma réplica do meteorito Bendegó, o maior meteorito brasileiro, encontrado em 1784, no município baiano de Monte Santo e classificado como o 11º mais importante do mundo.
Em uma sala denominada de Energia dos Cristais encontram-se peças muito interessantes, como gemas e pedras semipreciosas, bolas de cristal e artesanatos feito com conchas. Uma outra sala está reservada para a coleção Otto Billian, fundador da Empresa Baiana de Minerais. Durante 50 anos, ele reuniu uma coleção de mais de quatro mil peças, das quais destacam-se os cristais de quartzo, as pedras preciosas, os minerais e réplicas de diamantes famosos, além de livros, revistas e manuscritos que falam sobre o assunto. Possui ainda um confortável auditório, com capacidade para 125 pessoas e equipado com projetor de slides, sistema de som digital e recursos tecnológicos. De terça-feira a domingo, o espaço funciona como o Cinema do Museu, com uma programação predominante de filmes de arte. Nos outros dias, o auditório é destinado a atividades educativas, eventos culturais e científicos.
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